一、經費來源
1.行政院環境保護署補助環保科技園區新建工程4億020萬元。
2.行政院環境保護署補助生態城鄉計畫「綠色隧道道路計畫-綠色城鄉永續發展建設計畫-2005年台南綠建築概念展示計畫」4955萬元。
3.行政院環境保護署補助生態城鄉計畫「公園綠地興闢或改善工程計畫-高鐵特定區及周邊綠地生態系統示範工程-生態城市基盤改造及景觀工程計畫」1700萬元。
4.工業區開發管理基金-在建工程-大新營工業區開發業務-其他項下3000萬元。
5.預算經費合計5億3675萬元。
二、工程招標發包階段
2-1 初期整地工程
1.94.08.23移辦採購局辦理發包程序，94.09.13第一次上網公告招標，預計94.09.26決標。
2.94.09.26開標，由建中工程公司以107萬元得標。
3.94.09.29報請開工，但因颱風連日豪雨，致使工程無法施作，故於94.09.29即報停工。
4.94.10.15報請復工，94.10.24報請完工。
5.94.11.22完成工程驗收作業，預計94.12.06辦理第二次工程驗收。
6.94.12.06完成第二次工程驗收，94.12.13進行刨除工程，俾利後續建築景觀工程(主體工程)之進行。
2-2建築景觀工程
1.94.08.16提送預算書圖至工務局，94.08.17專案管理廠商(王家祥建築事務所)完成審核，94.08.19移辦採購局辦理發包作業。
2.94.08.23~94.08.29上網公開閱覽，預計94.09.29決標。
3.94.09.29第一次開標，無廠商投標，故宣布流標。
4.94.09.30辦理第二次公開招標，預計94.10.11第二次開標。
5.因原物料上漲，導致第一次開標無廠商投標，考慮工程發包時效性及環保署控管考核點(94.09.30前動工)，94.10.05副縣長裁示，增加工程預算9655萬元(3000萬+4955萬+1700萬)，請曾永信建築師事務所變更預算書圖，以利工程方能順利發包。
6.94.10.11第二次開標，無廠商投標，故宣布流標。
7.94.10.12依曾永信建築師事務所修正後預算書(招標金額增加4155萬元)移辦採購局辦理辦理發包，94.10.14第二次上網公告招標，以利工程儘速發包，另簽辦無需再次公開閱覽，預計94.11.08開標。
8.94.11.08開標，投標廠商不足三家，宣布流標，預計94.11.17第二次開標。
9.94.11.17第二開標，佳榮營造有限公司以4億900萬元得標。
10.94.12.02完成簽約，依契約規定簽約10日報請開工，故94.12.10報請開工，惟建築執照尚未取得，於同日報請停工。
11.95.02.24取得建築執照，95.04.14報請復工。
12.95.04.19管研大樓現地已進行基礎工程開挖，並完成圍籬工程及工務所硬體建築。
13.95.06.07由王家祥建築師事務所協調本案承包商佳榮營造公司及大新營工業區整地廠商建中公司進行協商，決議：經貿科技局及建中公司儘速建造臨時便道，以供佳榮工程材料及工程機具運輸，使管研工程盡速復工。但目前臨時聯外道路正尚在建造中，且因連日大雨工地嚴重積水，故95.05.27佳榮營造公司報請停工，目前完成基礎開挖，施工進度3.0% (95.04.14開工，95.05.27停工，實際施工天數43天，本案工期510日曆天，以施工天數核算進度約8.4%)。
14.前述導致停工因素消滅，土建承商已於95.08.01報請復工，進行結構體工程。
2-3水電空調工程
1.預定94.12.29開標，但因冷凍工會對其招標文件尚有疑義，須待釋義後再行上網公告招標。
2.94.12.20公告招標，預定95.01.05開標。
3.95.01.05開標，投標廠商不足三家故流標，預計95.1.17第二次開標。
4.95.1.17第二次開標，因廠商底價未達本府底價故流標，預計95.01.26第三次開標。
5.95.01.26第三次開標，因管線材料物價上漲，故無廠商投標故流標，已請曾永信建築師事務所檢討減項相關事宜，以利工程發包。
6.95.02.27依曾永信建築師事務所修正後預算書(工程預算增加850萬元)，預計95.03.14移請採購局辦理發包作業。
7.95.03.20第二次上網公告，預計95.04.11開標。
8.95.04.11開標，三家投標廠商投標金額均未入底價，因業務單位說明確有緊急情事，保留底價決標。
9.95.04.27決標，由科銘水電工程有限公司以8,690萬得標。。
10.95.05.09完成簽約，95.05.17報請開工，本案工期為建築景觀工程完工後45天內完工。
11.96.10.16實驗廠房施作項目為：鋁格柵施工、5F室內粉刷、1~5F男女廁所地坪防水施工、5F室內灰誌施做、1~5F批土油漆、電梯施工。管研大樓施做：會議室G4施工、2F東南西北側抿石子、3F東側抿石子、甲梯粉刷、電梯施工、1~3F男女廁地坪防水施工、2F及3F磨石子磚施工。
12.96.10.16水電承商配合土建承商進行施工，並由監造單位協調同籌，實驗廠房水電施做：給排水配管、排煙風管及閘門安裝。管研大樓水電施做：電氣幹管吊管施作、空調保溫施作、污水吊管配管。
13.專案管理(含監造)目前對承商進場材料及設備進行查驗、送審資料審核及施工現場查驗及協助承商關於查核缺失之改善，並對承商進行不定時之督導。
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